home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Celestin Apprentice 5 / Apprentice-Release5.iso / Source Code / Libraries / DCLAP 6d / dclap6d / SeqPups / tables / hum.cod < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1996-07-05  |  3.2 KB  |  95 lines  |  [TEXT/R*ch]
  1.  
  2. Homo sapiens
  3.  
  4. 1952 genes found in GenBank 63.
  5.  
  6.  Produced by J. Michael Cherry (cherry@frodo.mgh.harvard.edu) with the
  7.  GCG program CodonFrequency.
  8.  
  9.  Duplicates, pseudogenes, mutant and synthetic genes were not included.
  10.  Coding regions were specified using the Feature Table of each entry, then
  11.  checked for accuracy. If more than one stop codon was found the sequence
  12.  was not included.
  13.  
  14. AmAcid  Codon     Number    /1000     Fraction   ..
  15.  
  16. Gly     GGG    10216.00     17.08      0.23
  17. Gly     GGA    11553.00     19.31      0.26
  18. Gly     GGT     8174.00     13.66      0.18
  19. Gly     GGC    14920.00     24.94      0.33
  20.  
  21. Glu     GAG    23226.00     38.82      0.59
  22. Glu     GAA    16460.00     27.51      0.41
  23. Asp     GAT    12834.00     21.45      0.44
  24. Asp     GAC    16192.00     27.06      0.56
  25.  
  26. Val     GTG    17112.00     28.60      0.48
  27. Val     GTA     3644.00      6.09      0.10
  28. Val     GTT     6162.00     10.30      0.17
  29. Val     GTC     8981.00     15.01      0.25
  30.  
  31. Ala     GCG     4349.00      7.27      0.10
  32. Ala     GCA     9271.00     15.50      0.22
  33. Ala     GCT    12104.00     20.23      0.28
  34. Ala     GCC    17006.00     28.43      0.40
  35.  
  36. Arg     AGG     7231.00     12.09      0.22
  37. Arg     AGA     7020.00     11.73      0.21
  38. Ser     AGT     6091.00     10.18      0.14
  39. Ser     AGC    11094.00     18.54      0.25
  40.  
  41. Lys     AAG    20214.00     33.79      0.60
  42. Lys     AAA    13356.00     22.32      0.40
  43. Asn     AAT     9827.00     16.43      0.44
  44. Asn     AAC    12741.00     21.30      0.56
  45.  
  46. Met     atg    13077.00     21.86      1.00
  47. Ile     ATA     3620.00      6.05      0.14
  48. Ile     ATT     8993.00     15.03      0.35
  49. Ile     ATC    13442.00     22.47      0.52
  50.  
  51. Thr     ACG     4071.00      6.80      0.12
  52. Thr     ACA     8996.00     15.04      0.27
  53. Thr     ACT     7924.00     13.24      0.23
  54. Thr     ACC    12873.00     21.52      0.38
  55.  
  56. Trp     TGG     8820.00     14.74      1.00
  57. End     TGA     1577.00      2.64      0.61
  58. Cys     TGT     5976.00      9.99      0.42
  59. Cys     TGC     8293.00     13.86      0.58
  60.  
  61. End     TAG      438.00      0.73      0.17
  62. End     TAA      570.00      0.95      0.22
  63. Tyr     TAT     7057.00     11.80      0.42
  64. Tyr     TAC     9858.00     16.48      0.58
  65.  
  66. Leu     TTG     6838.00     11.43      0.12
  67. Leu     TTA     3320.00      5.55      0.06
  68. Phe     TTT     9191.00     15.36      0.43
  69. Phe     TTC    12399.00     20.72      0.57
  70.  
  71. Ser     TCG     2622.00      4.38      0.06
  72. Ser     TCA     6554.00     10.96      0.15
  73. Ser     TCT     8085.00     13.51      0.18
  74. Ser     TCC    10394.00     17.37      0.23
  75.  
  76. Arg     CGG     6224.00     10.40      0.19
  77. Arg     CGA     3366.00      5.63      0.10
  78. Arg     CGT     3088.00      5.16      0.09
  79. Arg     CGC     6476.00     10.82      0.19
  80.  
  81. Gln     CAG    19710.00     32.95      0.73
  82. Gln     CAA     7141.00     11.94      0.27
  83. His     CAT     5720.00      9.56      0.41
  84. His     CAC     8374.00     14.00      0.59
  85.  
  86. Leu     CTG    23890.00     39.93      0.43
  87. Leu     CTA     3840.00      6.42      0.07
  88. Leu     CTT     6727.00     11.24      0.12
  89. Leu     CTC    11448.00     19.14      0.20
  90.  
  91. Pro     CCG     4200.00      7.02      0.11
  92. Pro     CCA    10239.00     17.11      0.27
  93. Pro     CCT    10785.00     18.03      0.29
  94. Pro     CCC    12270.00     20.51      0.33
  95.